h1

Jak nawlec płytkę z dziurką na nić DNA? Albo i odwrotnie? ;)

Sierpień 9, 2010

Nowa elektryczna metoda sekwencjonowania genomu może dać wynik po kilku minutach i to kosztem zaledwie 100 dolarów – informuje „New Scientist”.

Pierwsza próba sekwencjonowania genomu zakończyła się po 10 latach i kosztowała miliardy dolarów. Teraz koszt to około 10 000 dolarów, jednak może spaść stokrotnie.W przeciwieństwie do dotychczasowych sposobów wykorzystujących zjawiska optyczne czy efekty biochemiczne, nowa metoda polega na przeciskaniu poszczególnych nici DNA przez maleńkie dziurki i mierzeniu ich elektrycznych właściwości poszczególnych nukleotydów. Opracowały ją wspólnie firmy IBM oraz Roche Applied Science. Zespołem IBM działającym w centrum badawczym w Yorktown Heights kierował Stanislaw Polonsky.

Przede wszystkim trzeba było uzyskać grubą na 10 nanometrów (miliardowych części metra) membranę z trzech warstw azotku tytanu oddzielonych warstwami krzemu, a następnie wywiercić w niej otwór o średnicy trzech nanometrów. Po przyłożeniu do membrany napięcia nić DNA jest wciągana w otwór, po czym napięcie jest odłączane. Kolejne zmiany napięcia pozwalają przesuwać poszczególne pary zasad, a środkowa warstwa azotku tytanu mierzy ich ładunki. Można osiągnąć prędkość do 1000 par zasad na sekundę dla pojedynczego otworu i używać wielu otworów jednocześnie. PMW

PAP – Nauka w Polsce

Szkoda, że nie mogę znaleźć więcej informacji na ten temat! Np. jaka jest dokładność tej metody…

Reklamy

5 Komentarzy

  1. Informacji jest mnóstwo (w literaturze). Ja tylko powiem, że to nie jest ani takie piękne, ani takie łatwe, jak to autor tej press release przedstawia… Zacznijmy od tego, że wywiercenie dziurki o średnicy 3 nanometrów… Że co proszę? Autor tego tekstu to w szkole chyba dawno nie był i nie pamięta, że 3 nanometry to jest rozmiar kilku atomów – jak mi znajdzie zatem wiertło tego rozmiaru, to mu pogratuluję. A to dopiero początek…

    Ale ogólnie temat jest fascynujący. Chociaż znowu „nowy”? Zależy jak na to spojrzeć: badania w tym kierunku są niezwykle intensywne i zapewniam Cię, że znacznie więcej grup bada i publikuje w tej dziedzinie…


  2. A mógłbyś mi podać jakieś namiary na informacje na ten temat? Albo chociaż pod jakim angielskim hasłem szukać…


  3. Szukaj ‚DNA sequencing’ w połączeniu z ‚nanopores’. Żadnej publikacji Ci nie podam, ale jest na pewno mnóstwo – u nas na wydziale są ze trzy grupy, które się tym zajmują, więc na spotkaniach grupowych raz za razem ludzie prezentują prace swoje i cudze na ten temat…


  4. Nowatorskie technologie sekwencjonowania powstają jak grzyby po deszczu, choćby Illumina (nie widziałam w akcji, ale wygląda fajnie), a to dopiero początek.
    Nie mogę się doczekać dalszego spadku kosztów odczytu sekwencji, póki co do w PL komercyjnie 1000nt kosztuje w okolicach 30zł 😉


  5. Zerknij koniecznie na materiał umieszczony w serwisie IBMa: http://www-03.ibm.com/press/us/en/pressrelease/32037.wss



Skomentuj

Wprowadź swoje dane lub kliknij jedną z tych ikon, aby się zalogować:

Logo WordPress.com

Komentujesz korzystając z konta WordPress.com. Wyloguj /  Zmień )

Zdjęcie na Google+

Komentujesz korzystając z konta Google+. Wyloguj /  Zmień )

Zdjęcie z Twittera

Komentujesz korzystając z konta Twitter. Wyloguj /  Zmień )

Zdjęcie na Facebooku

Komentujesz korzystając z konta Facebook. Wyloguj /  Zmień )

Connecting to %s

%d blogerów lubi to: